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Corpus Systématique Animale

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Compositional properties of coding sequences and mammalian phylogeny

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Éditeur
Springer (journals)
Langue(s) du document
Anglais
Type de document
Research-article
Mots-clés d'auteur
  • Isochores
  • DNA
  • Mammals
  • Rodents
  • Myomorpha
  • Murids
Nom du fichier dans la ressource
Mammiferes_v2b_02076
Auteur(s)
  • Dominque Mouchiroud 1
  • Giorgio Bernardi 2
Affiliation(s)
  • 1) Laboratorie de Biométrie, Génétique et Biologie des Populations, U.R.A. 243, Université Claude Bernard, 69600, Villeurbanne, France
  • 2) Laboratorie de Génétique Moléculaire, Institut Jacques Monod, 2 Place Jussieu, 75005, Paris, France
Résumé

The compositional distributions of large DNA fragments reflect those of the isochores that make up vertebrate genomes and can provide novel phylogenetic insights in the case of mammalian genomes (see Sabeur et al. 1993). This approach has been complemented here by an analysis of the compositional patterns of coding sequences and their codon positions (which also reflect the isochore pattern) and by a comparison of the base compositions of codon positions from homologous genes in a number of pairs of species. The results obtained using these two approaches support the existence of a general compositional pattern for mammalian genomes and of a distinct pattern for Myomorpha. The other two “special” patterns identified in a megachiropteran and in pangolin could not be tested here.

Catégories Science-Metrix
  • 1 - natural sciences
  • 2 - biology
  • 3 - evolutionary biology
Catégories INIST
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Catégories WoS
  • 1 - science ; 2 - genetics & heredity
  • 1 - science ; 2 - evolutionary biology
  • 1 - science ; 2 - biochemistry & molecular biology
Identifiant ISTEX
E7108303802FA9C67354CCA04D622CEA0594C766
Revue

Journal of Molecular Evolution

Année de publication
1993
Présence de XML structuré
Non
Version PDF
1.3
Score qualité du texte
6.595
Sous-corpus
  • Mammiferes
Type de publication
Journal
ark:/67375/1BB-CL4BSKPV-D
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